Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HPGDP15428 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HPGDP15428 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HPGDP15428 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HPGDP15428 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HPGDP15428 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HPGDP15428 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HPGDP15428 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HPGDP15428 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms