Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SFTPCP11686 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SFTPCP11686 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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