Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4BP0C0L5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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