Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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