Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDN1P05305 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EDN1P05305 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EDN1P05305 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms