Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RCBTB2O95199 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms