Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SKAP2O75563 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms