Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NIPSNAP2O75323 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms