Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC9O60706 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC9O60706 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC9O60706 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ABCC9O60706 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC009646.2-202ENST00000524425 826 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms