Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACSL4O60488 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms