Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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