Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms