Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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