Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APEX2Q9UBZ4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms