Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTSFQ9UBX1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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