Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms