Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PFDN4Q9NQP4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PFDN4Q9NQP4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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