Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms