Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms