Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SYNGAP1Q96PV0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNGAP1Q96PV0 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms