Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK5RAP3Q96JB5 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms