Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMARCE1Q969G3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms