Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
GIPC3Q8TF64 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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