Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q71RC1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q71RC1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q71RC1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms