Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL3Q6DD88 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms