Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms