Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF212Q495C1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms