Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CCDC96Q2M329 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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