Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NEDD8Q15843 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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