Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB39AQ14964 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms