Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTCH1Q13635 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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