Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AL139353.2-201ENST00000549844 699 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CAMK2BQ13554 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CAMK2BQ13554 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 LINC01259-201ENST00000507056 757 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CAMK2BQ13554 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CAMK2BQ13554 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 RN7SL488P-201ENST00000585186 286 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CAMK2BQ13554 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CAMK2BQ13554 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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