Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PMS2P3Q13401 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PMS2P3Q13401 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PMS2P3Q13401 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PMS2P3Q13401 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMS2P3Q13401 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PMS2P3Q13401 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PMS2P3Q13401 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PMS2P3Q13401 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PMS2P3Q13401 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PMS2P3Q13401 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P3Q13401 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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