Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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PTPN13Q12923 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PTPN13Q12923 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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