Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSPL2Q05D32 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms