Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HSF1Q00613 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms