Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5Q00535 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CDK5Q00535 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CDK5Q00535 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms