Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBP5P82980 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP5P82980 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBP5P82980 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms