Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSE1LP55060 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSE1LP55060 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms