Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MCAMP43121 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCAMP43121 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCAMP43121 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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