Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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