Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP1P29466 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms