Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
HLA-DMAP28067 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms