Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB2P26583 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms