Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DESP17661 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DESP17661 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DESP17661 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DESP17661 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DESP17661 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DESP17661 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DESP17661 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms