Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYN1P17600 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYN1P17600 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYN1P17600 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms