Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CTLA4P16410 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms