Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC172P0C7W6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC172P0C7W6 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms