Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 AC009227.1-201ENST00000434635 2362 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TNFRSF6BO95407 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TNFRSF6BO95407 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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