Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPFIA3O75145 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.9 ms